“防非”、“抗洪”、“食品卫生”、“防控禽流感”......即将过去的五年，人们从未如此深刻地感受到健康是多么的重要，卫生事业是多么的重要！在一连串的各类突发卫生事件中，公共卫生愈发显示出无比的重要性和紧迫性。如果要问五年来卫生事业最大的进步是什么，绝大多数的人必会毫无疑问地回答：公共卫生正日益加紧步伐走进百姓生活。 
农村卫生事业曲折中大发展。没有广大农民的健康就没有全面的和谐社会，一场率先启动的农村医疗保障制度让农民看病也可报销了。2003年，我市被省政府确定为全省10家新型农村合作医疗试点单位之一。当年就有1.8万患病农民家庭得到补助，有效缓解了因病致贫和返贫问题。今年，我市共有53.9万人参保，参保率达92.58%。《高邮市新型农村合作医疗管理办法》出台后，“即时审核结报”制度受到参合人员的普遍欢迎。同时这种新型农村合作医疗的补偿模式也得到有关上级部门的认可，并向全国推广。在此基础上，村卫生所建设、集镇卫生院改革与发展如火如荼。按照绩效优先、兼顾公平，以及生产要素参与分配的原则，我市推行了人事代理制度和全员聘用合同制，同时还开展了医疗卫生单位多种形式改革的探索，一改往日的尴尬位置，有效推进了卫生体制改革步伐。
卫生基础设施建设明显加快。为打造温馨的医疗服务环境，市人民医院筹资1400多万元，建成苏北地区同级医院中一流的急救中心大楼；中医院投资1100多万元建设现代化的中西医结合病房大楼；异地新建了3家医疗卫生单位，7家一级医院病房重新建设，造福了高邮一方百姓。同时，围绕群众反映强烈的看病难问题，实施“名医、名科、名院”工程。特别是人民医院普外科和中医院中医骨伤科、中西医结合肾病科已创成扬州市重点专科和中医特色专科，并在苏北地区同级医院中处于领先地位。
公共卫生体系不断完善。近年来，我市在撤消市卫生防疫站和血吸虫病防治站后，组建了疾病预防控制中心和卫生监督所，加大了卫生执法监督和疾病预防控制力度。全市甲、乙类传染病总发病率降至106.79/10万，“四苗”接种率达98%以上。2003年，我市全面预防阻击“非典”，取得了“零病例”、“零疫情”的重大胜利，针对百年未遇的特大洪涝灾害，启动救灾防病预案，实现了大灾之年无大疫。同时，着力打击卫生违法行为，2005年1至10月份共查处违法案件295起，结案280起，销毁不合格食品3800公斤。