南关坝在城南五里处(今运东船闸处)，过去称五里坝。

为保护好这处新发现的历史文化遗址，政府拨款对南关坝进行了修缮保护。在坝顶建正门三间，左右附属房各三间。南关坝坝体四周砌了仿古式围墙，形成一院落。北端裏头和部分流线型滚水坡皆在院内。游人可顺坡台走至坝底，观看四面围墙壁上布置的归海五坝文化长廊。

南关坝是明永乐十二年(1414)陈瑄为平江伯时所建，此为减水坝，即开坝泄洪。清康熙二十年(1681)，河臣靳辅来高邮，他重视水情，把原土坝改建成三合土(熟土、砂石和石灰搅拌而成，十分坚固)坝。康熙四十年(1881)，河臣张鹏翮来高邮，他把坝改成为坚不可摧的石坝。改建后的南关坝是滚水坝(或称漫水坝)。滚水坝设定了一定高度，其功能为：水涨听其自漫而保堤，水小听其涵蓄而济运。简单说，在保证漕运通畅情况下，让多余的水尽早排出，以减轻运堤压力。这些流水滚过坝上的流线型水坡之后，经运盐河进入兴化南官河，再由车路河入海。

南关坝位于五坝最北端，向南分别为中坝、新坝、车逻坝、昭关坝，史称归海五坝。

南关坝的建设是颇具匠心的。南北的裏头均为条石砌就，条石间用石灰汁与黏米汁调和成的汤汁粘合，石缝小至近无。坝底的流线型，引导漫水而降低水的阻力及对坝体冲刷的破坏，且十分具有美感和观赏性。坝体构造十分严谨。最下层密布若干根水旱千年的杉木桩，这是防止地基塌陷而破坏坝体。木桩基间是密实的三合土，有水泥般坚硬又有韧性。三合土上是钢绳织成的网。网格长条形，四角有铁铸长方块。铁块两边有九十度凹陷，只容条石的角嵌入，显出坝面平整完美。整个工程有许多不可思议：首先这近百根杉木桩，在没有机械力的帮助下，如何垂直地打到五六米深的地下，难度不可思议;其二，当时高邮没有轧钢冶炼技术，这坝底的钢绳网如何浇织成，不可思议;其三，用以固定条石的铁块大小略有差异，这说明不是一个模具浇铸，它如何与钢绳连接成一体，不可思议。唯一的可能是现场冶炼浇铸。这南北坝体间有二百多米，在没有现代科技的情况下，完全靠人力智慧，把这样一个经过二百多年洪水考验而纹丝不动的工程做得这么坚实完美，需要多么严谨细致认真，这是可以想见的。